بانک بذر خاک شامل تمامی بذور زنده گیاهان (چه در حالت خواب و چه فعال و آماده جوانه زنی) و میوه حامل این بذور در خاک است.در اراضی زراعی، مهمترین کاربرد بانک بذر خاک، نقشی است که در کنترل علفهای هرز دارند. در رویشگاههای طبیعی شامل جنگلها و مراتع، از بانک بذرخاک برای احیا اراضی تخریب یافته، حفظ تنوع گیاهی و افزایش و نگهداری ذخیرهگاه ژنتیکی گیاهان استفاده می گردد. در مطالعه بانک بذر خاک، ویژگیهای مختلفی از جمله تنوع، تراکم و تشابه بانک بذر خاک با پوشش گیاهی روزمینی بررسی میشود. روشهای مختلفی برای شناسایی بذور مدفونشده در خاک و اندازهگیری این ویژگیهای فوق ارائه شده است. همچنین عوامل مختلف زنده و غیرزنده از قبیل چرای دام، نوع پوشش گیاهی سطحی، عوامل خاکی، اقلیم و ویژگیهای توپوگرافی بر هرکدام از این ویژگیهای بانک بذر خاک تأثیر معنی دار دارد. همچنین با توجه به تغییرات ویژگیهای بانک بذر خاک در اعماق مختلف خاک، بذور مدفونشده در خاک به قسمتهای مختلفی طبقهبندی شدهاند که تفکیک آنها به دو قسمت دائمی و زودگذر در مطالعات مختلف، بیشتر مد نظر قرار گرفته است. در نهایت اینکه برای تجزیه و تحلیل داده های مربوط به بانک بذر خاک می توان از نرمافزارهای مختلفی که برای مطالعات اکولوژی گیاهی ارائه شده است، استفاده کرد. در این بین استفاده از بسته vegan در نرم افزار R پیشنهاد می گردد. در این کتاب تمامی موارد فوق بهصورت مفصل بحث و بررسی شده است.